Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cab39lQ9DB16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39lQ9DB16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39lQ9DB16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms