Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S3

Rwdd2a, RWD domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2aQ9D9S3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rwdd2aQ9D9S3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rwdd2aQ9D9S3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rwdd2aQ9D9S3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rwdd2aQ9D9S3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rwdd2aQ9D9S3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rwdd2aQ9D9S3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd2aQ9D9S3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd2aQ9D9S3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms