Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calr3Q9D9Q6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr3Q9D9Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr3Q9D9Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms