Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actrt1Q9D9J3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actrt1Q9D9J3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actrt1Q9D9J3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms