Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf225Q9D7D1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf225Q9D7D1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf225Q9D7D1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf225Q9D7D1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.9 ms