Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptp4a3Q9D658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptp4a3Q9D658 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptp4a3Q9D658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptp4a3Q9D658 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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