Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox2aQ9D4Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox2aQ9D4Y3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhox2aQ9D4Y3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms