Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf6Q9D4J7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf6Q9D4J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf6Q9D4J7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms