Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp4Q9D4F8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms