Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam90a1bQ9D4F3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms