Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933428M09RikQ9D3X3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms