Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaaf1Q9D2H9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnaaf1Q9D2H9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnaaf1Q9D2H9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaaf1Q9D2H9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms