Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc8Q9D2H8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fndc8Q9D2H8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms