Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930583I09RikQ9D2E3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930583I09RikQ9D2E3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms