Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2cQ9D1C1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2cQ9D1C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2cQ9D1C1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2cQ9D1C1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms