Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Elp3Q9CZX0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Elp3Q9CZX0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Elp3Q9CZX0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Elp3Q9CZX0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elp3Q9CZX0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elp3Q9CZX0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms