Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc77Q9CZH8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc77Q9CZH8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc77Q9CZH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms