Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rex1bdQ9CYZ6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rex1bdQ9CYZ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rex1bdQ9CYZ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rex1bdQ9CYZ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms