Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms