Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgme1Q9CXC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgme1Q9CXC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mgme1Q9CXC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mgme1Q9CXC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mgme1Q9CXC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mgme1Q9CXC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mgme1Q9CXC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mgme1Q9CXC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mgme1Q9CXC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms