Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prkrip1Q9CWV6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prkrip1Q9CWV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms