Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NmbQ9CR53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NmbQ9CR53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NmbQ9CR53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NmbQ9CR53 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms