Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms