Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkn2Q9CQS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gkn2Q9CQS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gkn2Q9CQS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms