Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl20Q9CQL4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl20Q9CQL4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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Mrpl20Q9CQL4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl20Q9CQL4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl20Q9CQL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms