Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTRAFQ9CQE8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTRAFQ9CQE8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms