Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700029P11RikQ9CQ68 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029P11RikQ9CQ68 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700029P11RikQ9CQ68 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms