Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CPS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CPS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CPS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CPS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CPS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CPS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CPS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CPS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CPS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CPS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CPS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CPS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CPS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms