Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GpnmbQ99P91 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GpnmbQ99P91 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GpnmbQ99P91 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GpnmbQ99P91 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms