Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pcgf6Q99NA9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pcgf6Q99NA9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcgf6Q99NA9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcgf6Q99NA9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms