Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gins4Q99LZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins4Q99LZ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins4Q99LZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins4Q99LZ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms