Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DhddsQ99KU1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DhddsQ99KU1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DhddsQ99KU1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms