Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmagpQ99KC7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmagpQ99KC7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms