Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TirapQ99JY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TirapQ99JY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms