Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lims1Q99JW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lims1Q99JW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lims1Q99JW4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms