Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlcd1Q99JT6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tlcd1Q99JT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlcd1Q99JT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlcd1Q99JT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlcd1Q99JT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms