Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krcc1Q99JT5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krcc1Q99JT5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krcc1Q99JT5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krcc1Q99JT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms