Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacsin3Q99JB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pacsin3Q99JB8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin3Q99JB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin3Q99JB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms