Protein–RNA interactions for Protein: Q920R6

Atp6v0a4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a4Q920R6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v0a4Q920R6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v0a4Q920R6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v0a4Q920R6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v0a4Q920R6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp6v0a4Q920R6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp6v0a4Q920R6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v0a4Q920R6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms