Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt16hQ920B9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt16hQ920B9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt16hQ920B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt16hQ920B9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms