Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde6cQ91ZQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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