Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha1Q91Y21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdha1Q91Y21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdha1Q91Y21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms