Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha12Q91Y18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha12Q91Y18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdha12Q91Y18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha12Q91Y18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha12Q91Y18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms