Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Crtc3Q91X84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crtc3Q91X84 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crtc3Q91X84 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crtc3Q91X84 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crtc3Q91X84 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crtc3Q91X84 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crtc3Q91X84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crtc3Q91X84 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms