Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa1Q8VEE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa1Q8VEE4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa1Q8VEE4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpa1Q8VEE4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa1Q8VEE4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms