Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slf1Q8R3P9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf1Q8R3P9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slf1Q8R3P9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf1Q8R3P9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms