Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
McmbpQ8R3C0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
McmbpQ8R3C0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
McmbpQ8R3C0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
McmbpQ8R3C0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
McmbpQ8R3C0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms