Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CcsapQ8QZT2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcsapQ8QZT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CcsapQ8QZT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CcsapQ8QZT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms