Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot6Q8K3P5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot6Q8K3P5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot6Q8K3P5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms