Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gin1Q8K259 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gin1Q8K259 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gin1Q8K259 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms